Священная война
Перед началом Великой Отечественной войны инженерные войска прошли «боевую стажировку» на р. Халхин-Гол (1939) и в Финляндии (1939-1940). В пустынях Монголии военные инженеры обеспечивали советские войска водой, поддерживали пропускную способность многокилометровых дорог, а также обеспечивали высокий уровень маскировки подразделений, скрывший развертывание советских войск от японской авиаразведки. Суровая финская зима требовала постоянного содержания путей движения войск в снегах, тайге и заболоченной местности, кроме того, ярким применением инженерных войск стал прорыв мощнейшей системы финских укреплений, известной как «Линия Маннергейма».
Июнь 1941-го застал многие формирования инженерных войск на укреплении новых пограничных рубежей, поэтому нападение гитлеровцев поставило войска в сложное положение. К ноябрю 1941 года структура инженерных войск расширилась должностями начальников инженерных войск фронтов, армий с созданием соответствующих штабов. В январе 1942 года создано 10 саперных армий (!), обеспечивших оборонительные действия Красной Армии в течение 1942 года. Затем в состав фронтов были переданы саперные бригады, а для борьбы с танками и другой техникой противника сформированы инженерные бригады специального назначения, ставшие, по сути, прообразом современных подразделений спецназа. С работой этих диверсионных подразделений была связана военная деятельность «дедушки русского спецназа» полковника Ильи Григорьевича Старинова (1900-2000), встретившего начало войны в должности начальника отдела минирования и заграждений Главного военно-инженерного управления Красной Армии. Старинов также руководил подготовленными в Нахабино военными инженерами – специалистами по работе с «техникой особой секретности» - первыми советскими радиоуправляемыми минами, не имевшими аналогов в мире. Одной из наиболее известных операций диверсионного подразделения стал подрыв штаба 68-й пехотной дивизии Вермахта во главе с генерал-лейтенантом Георгом фон Брауном осенью 1941 года в Харькове. Примечательно, что заряд управлялся по радиосигналу из Воронежа (!).
Весной 1943 года для поддержки наступающих частей и прорыва обороны противника создаются штурмовые инженерно-саперные бригады. Проходы в минных полях противника ложились на плечи сформированных инженерно-танковых полков, а для разминирования освобождаемой территории в войсках появились 6 бригад разграждения. В общей сложности численность инженерных войск на конец 1943 года насчитывала 58 бригад, 9 полков и более 1000 различных батальонов. И это количество полностью себя оправдало. Инженеры возводили оборонительные сооружения, устраивали заграждения, минировали местность, форсировали реки (в т.ч. Днепр, Вислу и Одер), проделывали проходы в минных полях, штурмовали гитлеровские цитадели, совершали диверсии в тылу противника, обеспечивали скрытие и маскировку действующих объектов и создавали ложные, в т.ч. мосты и аэродромы.
За годы войны инженерными войсками установлено более 70 млн противотанковых и противопехотных мин, на которых противник потерял до 10 тысяч единиц бронетанковой техники и до 100 тысяч человек личного состава. Разминировано 765 тысяч кв. км территории 400 тысяч км путей. Построено 11 тысяч мостов, проложено 500 тысяч км дорог. Неприступный город-крепость Кенигсберг, который обороняли до 130 тысяч гитлеровцев, 4 тысячи орудий и минометов, 108 танков и штурмовых орудий, 178 самолетов, был взят за 4 дня благодаря саперам-штурмовикам. Отважные воины в стальных нагрудниках первыми прорывались к укрепленному объекту противника, подрывая его удлиненными зарядами, что открывало путь наступающим подразделениям.
За ратные подвиги в годы войны 655 воинов-инженеров удостоены высокого звания Героя Советского Союза, 315 человек стали полными кавалерами ордена Славы (из 2780 полных кавалеров за всю историю). 6 инженерных бригад, 241 инженерный батальон получили звания Гвардейских, десяткам подразделений присвоены почетные наименования.